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Chinese Journal of Cancer Biotherapy ; (6): 990-997, 2021.
Article in Chinese | WPRIM | ID: wpr-906709

ABSTRACT

@#[摘要] 目的:寻找多发性骨髓瘤(MM)基因芯片数据集中的潜在致病基因、疾病诊断和预后相关因子并阐明其作用机制。 方法:获取基因芯片数据集GSE13591 和Zhan Myeloma,使用R 语言进行基因差异表达分析。对共同高表达基因进行Meta 分 析,得到P 值中位秩次TOP10 基因。CCLE 数据库分析TOP10 基因在各肿瘤细胞系中的mRNA表达情况,筛选出蛋白酶体通路 相关基因8(DCAF8)。cBioPortal 数据库中分析DCAF8 基因在各肿瘤细胞系的突变率。WB检测DCAF8 蛋白在骨髓瘤细胞系中 的表达情况。SPSS 和Graph Pad 软件分析DCAF8 表达量和MM患者临床特征之间的相关性,进行受试者工作特征曲线(ROC曲 线)绘制和生存分析。R语言Custer Profiler Package 和Metascape 数据库对DCAF8 互作蛋白基因和共表达基因进行GO和KEGG 功能富集分析。结果:数据集GSE13591 和Zhan Myeloma 的上调基因取交集得到477 个共同高表达基因。在合并数据集中对上 述基因进行Meta 分析,得到P 值中位秩次TOP10 基因,DCAF8 在MM细胞系中的平均表达水平最高。DCAF8 基因在浆细胞骨 髓瘤中的突变率位于各肿瘤细胞系的第一位。DCAF8 蛋白在多种MM细胞系中的表达量显著升高(P<0.01)。DCAF8 表达量与 MM患者的肿瘤负荷显著正相关,1q21 扩增阳性组的DCAF8 的表达量显著高于1q21 阴性组。ROC曲线显示DCAF8 的表达水平 可以很好地区分MM患者和正常人(P<0.01)。DCAF8 高表达组比DCAF8 低表达组中位生存时间显著缩短。蛋白互作网络显示 DCAF8 可与XPO1 蛋白直接相互作用。GO和KEGG功能富集分析结果表明,DCAF8 与蛋白酶体功能、剪切体活性、组蛋白乙酰 化酶活性、RNA转运等功能相关。结论:DCAF8 在MM中显著高表达,其表达水平可以很好地区分MM患者和正常人;其高表 达与MM患者的生存预后显著负相关,且与1q21 扩增和XPO1 蛋白相关。

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